Su tamaño es de 48 por 26 metros, la hace sin duda la moyor de todo el periodo, siendo además la más extraña por su planta, conocida gracias a su plano del siglo XVIII, época en que se estudiaron estas ruinas por primera vez, cuando su estado de conservación era mejor que el actual. Pudieron observarse entonces características hoy perdidas , entre ellas la existencia de arcos de herradura en alzado, y tal vez empleados aquí por primera vez en España.

La planta tiene forma de "T", con tres naves separadas por diez columnas, algunas de ellas aprovechadas de edificios romanos que pudieron ser tomadas de edificios cercanos, pues en los alrededores se han encontrado una serie de vestigios de época romana, como estancias diversas y un columnario donde se hallaron urnas con cenizas, mascarillas de barro y otros accesorios .

El crucero está muy desarrollado en uno de sus brazos, con una serie de habitáculos de uso no muy claro, que estaría además sobrealzado respecto del nivel del suelo del edificio. El ábside es atípico por su forma ultrasecular, ya que en todas las demás iglesias visigodas conservadas se presenta cuadrado tanto interior como exterior. A los pies debió de tener un segundo ábside dedicado a enterramientos, como en algunas basílicas paleocristianas del norte de África.