La Laguna del Hito es de carácter endorreico, salina y estacional, con períodos de inundación fluctuantes en distintos años. Se caracteriza por su gran extensión, poca profundidad, ausencia de vegetación palustre y por la existencia de pastizales en su cuenca que se encharcan en función de los niveles de agua . Pero su característica más destacable es la concentración de grulla común en paso migratorio.

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El interés faunístico de la laguna se centra en la comunidad de aves acuáticas y en especial en las concentraciones de grulla común en paso migratorio desde Francia, habiéndose contabilizado máximos de hasta 9500 individuos, lo que le confiere a la zona la categoría de importancia internacional Ramsar. También se han superado ocasionalmente los criterios de importancia internacional para nidificación y paso de cigüeñuela y avoceta y los de nidificación de avefría.

A nivel nacional destaca la invernada de anátidas como cerceta común, pato cuchara y ánade rabudo y ocasionalmente tarro blanco, ánade real, silbón y friso y porrón común.
En paso migratorio se han registrado Cigüeña blanca, espátula y chorlito carambolo entre otras.

Los mamíferos se pueden encontrar diversas especies amenazadas como el erizo, el topo, la comadreja y varias especies de murciélagos.

Cuando la permanencia del agua lo permite, la cubeta lagunar se cubre por praderas subacuáticas de carófitos, con Chara galiodes como especie dominante y otros carófitos como Tollypella sp. y Chara canescens. Un segundo estrato lo formaría el macrófito Ruppia drapanensis que surge entre las praderas de carófitos. En primaveras lluviosas, cuando la salinidad es baja, en las zonas someras aparece Ranunculus peltatus sps. peltatus y Zannichellia pedunculata.

La vegetación marginal se compone de distintas formaciones halófilas en las que dominan, de mayor a menor humedad edáfica:

• Colindate con el agua domina la castañuela, Scirpus maritimus.
• Pastizal salino continental de plantas pioneras carnosas con especies como Salicornia ramosissima y Suaeda splendidens.. Forman bandas de color rojizo en los bordes de la laguna cuando se seca.
• Praderas graminoides vivaces de Puccinellia fasciculata.
• Finalmente se observa la comunidad de plantas anuales, rastreras, nitrófilas caracterizada por Lithrum flexuosum que es sustituida en las zonas algo más elevadas por albardinar con Lygeum spartum (albardín), diversas especies de Limonium endémicas y pequeños rodales de Mycrocnemum coralloides.
• En los bordes de los caminos y claros de las formaciones graminoides, se desarrollan praderas de plantas anuales halonitrófilas caracterizadas por Frankenia pulverulenta.

Otras especies de interés son: Gypsophila bermejoi, Lepidium cardamines.